organismo

«Entidad» es una palabra comodín para cualquier grupo organizado (empresa, club, banco), mientras que «organismo» suele referirse a una institución oficial o pública con funciones concretas, como un ministerio o una agencia.
«El organismo público regula la sanidad.» · «La entidad bancaria nos concedió el préstamo.»

«Ente» se usa sobre todo en lenguaje jurídico o formal para referirse a una institución abstracta con personalidad propia, mientras que «organismo» es más común y concreto para un grupo que funciona dentro de una estructura mayor.
«La universidad es un organismo autónomo.» · «El ente público gestiona las becas.»