anotación

«Anotación» suena más formal y técnica, propia de apuntes de estudio o registros; «nota» es la palabra cotidiana para un papelito o mensaje breve que usas en la vida diaria.
«Tomé una anotación sobre la conferencia en mi cuaderno.» · «Le dejé una nota en la nevera para recordarle la cena.»

«Anotación» es un registro formal y personal de un dato importante, mientras que «apunte» es la nota rápida que tomas en clase para no olvidar lo explicado.
«Hice una anotación en el margen del contrato.» · «Toma apuntes de la lección de historia.»

La anotación es una nota breve y personal para recordar algo, mientras que el comentario es un texto más elaborado que analiza o explica algo para que otros lo entiendan mejor.
«Hice una anotación en el margen: 'repasar mañana'.» · «Escribió un comentario sobre el poema para la clase.»